Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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