Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Prrt1O35449 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Prrt1O35449 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrt1O35449 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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