Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnih1O35372 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnih1O35372 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnih1O35372 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnih1O35372 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Cnih1O35372 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cnih1O35372 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Cnih1O35372 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cnih1O35372 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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