Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
EllO08856 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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EllO08856 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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EllO08856 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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EllO08856 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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EllO08856 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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EllO08856 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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EllO08856 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EllO08856 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EllO08856 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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