Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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MttpO08601 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MttpO08601 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MttpO08601 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MttpO08601 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MttpO08601 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MttpO08601 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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MttpO08601 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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MttpO08601 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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