Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm2056J3QQ02 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms