Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm2035J3QP87 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms