Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms