Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms