Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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