Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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4930544D05RikJ3QK56 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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4930544D05RikJ3QK56 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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4930544D05RikJ3QK56 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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4930544D05RikJ3QK56 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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