Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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