Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm20830J3KML6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm20830J3KML6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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