Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AK157302I3ITR1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms