Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc1E9Q043 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms