Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Sfta2E9PXB6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms