Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc8E9PWG2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc8E9PWG2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms