Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms