Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc6D3YZP9 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ccdc6D3YZP9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc6D3YZP9 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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