Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
BC048679D3YXE9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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