Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rd3lB2RV38 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms