Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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