Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Brpf1B2RRD7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Brpf1B2RRD7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms