Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Grik3B1AS29 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Grik3B1AS29 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Grik3B1AS29 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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