Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slfn8B1ARD8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms