Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms