Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtf1A2AQ19 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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