Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ambra1A2AH22 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ambra1A2AH22 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms