Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms