Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Cldn8Q9Z260 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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