Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trip6Q9Z1Y4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms