Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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