Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc1Q9QZF2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms