Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rad18Q9QXK2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms