Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdcQ9QW08 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdcQ9QW08 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdcQ9QW08 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PdcQ9QW08 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PdcQ9QW08 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms