Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vstm2bQ9JME9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vstm2bQ9JME9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms