Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sfmbt1Q9JMD1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sfmbt1Q9JMD1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sfmbt1Q9JMD1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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