Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tnfrsf19Q9JLL3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms