Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Tgm1Q9JLF6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tgm1Q9JLF6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms