Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Scamp5Q9JKD3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms