Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ccl28Q9JIL2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms