Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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ClpxQ9JHS4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
ClpxQ9JHS4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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