Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Clstn1Q9EPL2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clstn1Q9EPL2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms