Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Nbdy-206ENSMUST00000208373 1061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Olfr687-201ENSMUST00000098154 938 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Riok3Q9DBU3 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms