Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB96

Ngdn, Neuroguidin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgdnQ9DB96 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NgdnQ9DB96 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NgdnQ9DB96 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms