Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc89Q9DA73 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc89Q9DA73 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms