Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf138rt1Q9D9M9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms