Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D8L0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q9D8L0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms