Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chmp4bQ9D8B3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms