Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nop56Q9D6Z1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms